Sa isang malayong mundo kung saan mayroon ang mahika, mayroong giyera sa pagitan ng dalawang bansa. Ang mga matalinong dragon ay lumahok dito sa magkabilang panig. Ngayon sa laro na Bakugan Armored Alliance ay makikilahok ka sa paghaharap na ito at makokontrol ang isa sa mga dragon. Ang iyong bayani ay kailangang lumipad sa isang tiyak na lugar at sirain ang lahat ng mga militar na bagay na nakatagpo sa daan. Bago ka sa screen makikita mo ang iyong character na iyong kontrolin sa tulong ng mga arrow. Sa sandaling mapansin mo ang isang target sa lupa, lumipad sa ibabaw nito at palabasin ang apoy. Aatakihin ka ng iba't ibang mga aircraft at iba pang mga dragon. Kailangan mong mapaglalangan sa himpapawid upang maiwasan ang kanilang pag-atake at mabaril ang lahat ng mga target na lumilipad.
