Ang isang maliit na nakakatawang nilalang na nagngangalang Jojo ay nakatira sa kailaliman ng kagubatan. Isang araw, narinig ng aming bayani na sa mga liblib na lugar sa gabi ng mga gintong barya ay lilitaw. Nagpasya ang aming karakter na pumunta sa mga lugar na iyon at mangolekta ng lahat. Ikaw sa laro Jojo Run ay makakatulong sa kanya sa ito. Ang iyong karakter ay tatakbo sa landas kasama ang lahat ng kanyang mga binti. Sa kahabaan ng paraan, makikita niya ang mga pagkabigo sa lupa, mga bitag at iba't ibang mga nilalang na may kakayahang pagpatay sa kanya. Lumapit sa lahat ng mga panganib na ito, kailangan mong gawin ang bayani tumalon at lumipad sa pamamagitan ng lahat sa pamamagitan ng hangin. Sa paraan magkakaroon ka upang mangolekta ng lahat ng mga barya na ito.
