Sa modernong mundo mayroong kaunting nakamamatay na mga virus na nagdudulot ng kamatayan sa iba't ibang mga nilalang na may buhay. Ngayon sa Patayin Ang Microbes ay kailangan mong labanan ang ilan sa kanilang mga species. Bago ka sa screen ay makikita mo ang maraming mga microorganism na matatagpuan sa iba't ibang mga lugar sa larangan ng paglalaro. Kailangan mong pumili ng isa sa mga ito at mag-click sa mouse gamit ang mouse. Sa ganitong paraan iniksyon mo ang gamot at ginagawang sumabog ang bacterium. Ang kanyang mga piraso na nahuhulog sa iba pang mga microorganism ay sirain ang mga ito at makakatanggap ka ng mga puntos para dito.
