Ang bawat kontra-terorismo na espesyal na puwersa ng pagsabog ay may sapper na kasangkot sa pag-iwas sa iba't ibang mga bomba. Ngayon sa Defuse Ang Bomba: Lihim na Misyon, tutulungan mo ang isa sa kanila. Bago ka sa screen ay lilitaw ang isang three-dimensional na imahe ng mga eksplosibo. Ang isang timer ay lilitaw sa itaas nito, na sumusukat sa oras bago ang pagsabog. Kailangan mong paikutin ang mga eksplosibo sa espasyo upang makahanap ng isang kumpol ng mga wires na pumapasok sa aparato ng piyus. Pagputol ng isang tiyak na kawad, ititigil mo ang timer at masira ang bomba.