Ang isa sa mga aristokrata ay umarkila ng isang pangkat ng ninja upang patayin ang emperador ng Hapon. Ikaw ay nasa Beat Ninja Blam! kailangan mong protektahan siya. Upang tumagos sa palasyo, ang mga mandirigma ng ninja ay gumawa ng isang paghukay. Ikaw ay ambus at maghihintay para sa kanilang hitsura. Bago ka sa screen makikita mo ang mga butas kung saan lilitaw ang ninja. Mabilis kang gumanti ay kailangang mag-click sa kanila gamit ang mouse. Sa gayon, sasaktan mo sila at sirain sila. Para sa bawat natalo na kaaway bibigyan ka ng isang tiyak na halaga ng mga puntos.
