Sa bagong laro ng Dot Run, pupunta ka sa isang mundo kung saan nakatira ang maliit na bola ng iba't ibang kulay. Bago ka sa screen ng dalawang bola ng dilaw na kulay ay makikita. Sa itaas ng mga ito ay matatagpuan mga bola ng itim na kulay na maaari mong kontrolin gamit ang mga espesyal na key. Sa itaas ng signal, ang mga bola na mayroon ding isang tiyak na kulay ay magsisimulang mahulog. Kailangan mong gumawa ng isang kasalukuyang upang ang mga dilaw na bagay ay makipag-ugnay sa eksaktong parehong mga bagay na kulay, at itim na may itim.
