Ang bayani ng laro Dead Nest ay isang biktima ng eksperimento. Nabuhay siya muli upang maipadala sa isang mundo na tinitirahan ng mga patay na ibon. Ito ay isang espesyal na mundo kung saan ang mga patay ay hindi nagsisinungaling sa lupa, ngunit kumikilos na parang sila ay nabubuhay, kaya walang lugar para sa mga nabubuhay. Dapat subukan ng bayani ang isang bagong sandata sa mga ibon na tinatawag na Green Ray. Ito ay natatangi hindi lamang sa maaari nitong sirain ang lahat ng mga nabubuhay at hindi nagbibigay ng mga bagay, kundi pati na rin sa kakayahan nitong mabawi dahil sa muling pagdadagdag ng enerhiya ng kaluluwa. Sa ibaba makikita mo ang mga berdeng ilaw, mayroong anim sa mga ito, na nangangahulugang ang bilang ng mga pag-shot na ang character ay limitado. Upang bumubuo para sa kanila, pumatay ng malalaking ibon upang kunin ang kanilang enerhiya.
