Ang batang siyentipiko na si Thomas ay nakarating sa isla at nagsimulang galugarin ito. Sa pamamagitan ng pagkakataon, nakatagpo niya ang isang nayon ng mga kanyon, na nagsagawa ng isang seremonya bilang paggalang sa Halloween nang gabing iyon. Ngayon ikaw ay nasa laro Halloween Island Running ay kailangang tulungan ang iyong bayani na makatakas mula sa kanilang pagtugis. Kung ang mga kanyon ay sumakay sa iyong bayani, ihahandog nila siya. Ang iyong bayani ay kailangang tumakbo kasama ang isang tiyak na kalsada. Magkakaroon ng maraming mga hadlang at iba pang mga mapanganib na lugar. Kailangan mong gamitin ang mga control key upang pilitin ang bayani na tumakbo sa paligid ng mga mapanganib na lugar na ito. Kolektahin ang iba't ibang mga item ng bonus na magbibigay sa iyo ng iba't ibang uri ng mga power-up sa kahabaan.
