Ang apprentice na si Tom ngayon ay kailangang tulungan ang kanyang guro na lumikha ng iba't ibang uri ng monsters. Ikaw sa laro Monster Merge sumali sa kanyang mga karanasan. Bago ka sa screen makikita mo ang ibabaw ng lupa na nasira sa isang pantay na bilang ng mga cell. Ang iba't ibang uri at kulay ng mga monsters ay lilitaw sa kanila. Maingat mong sinusuri ang lahat ay magkakaroon upang makahanap ng dalawang magkaparehong nilalang. Pagkatapos, gamit ang mga espesyal na arrow ng control, ikinonekta mo ang mga ito sa isang linya. Pagkatapos sila ay pagsamahin, at nakakakuha ka ng isang bagong uri ng pagkatao.
