Ang isang maliit na puting robot ay magpapadala ng isang pangkat ng mga ninja turtle sa isang paglalakbay sa puwang. Kailangan nilang makumpleto ang maraming napakahalagang misyon. Pumili ng isang misyon at bayani na matutupad ito, at pumunta sa lokasyon. Kailangan naming lumipad sa mga fighters ng espasyo at sirain ang isang daang asteroid. Pupunta ka sa isang planeta kung saan ang lakas at kagalingan ng kamay ay gaganapin sa mataas na pagpapahalaga at labanan sa arena kasama ang mga sikat na lokal na mandirigma. Ang bawat misyon ay isang hiwalay na kuwento na may sariling mga twists. Saanman kailangan mo ng lakas, kagalingan ng kamay, kagalingan ng kamay na tinataglay ng aming mga bayani sa Teenage Mutant Ninja Mga Pagong sa Space.
