Sa isa sa mga isla na nawala sa karagatan, mayroong isang lungsod kung saan maaaring makapagpahinga ang mga pirata pagkatapos ng kanilang pagsalakay sa dagat. Ang isa sa mga madilim na wizards ay nagpasya na sirain ang lungsod at magpadala ng isang hukbo ng mga buhay na patay dito. Ngayon ikaw ay nasa laro Pirate Zombie Defense ay kailangang mag-utos ng depensa. Makakakita ka ng isang kalsada na kung saan ang mga zombie ay lilipat patungo sa mga tirahan. Sa tulong ng isang espesyal na panel, kakailanganin mong lason ang mga pirata sa labanan at hampasin nila ang mga zombie sa kanilang mga sabers.
