Sa pixel world nagsimula ang katapusan ng mundo. Hindi ito alam kung saan nanggaling ang mga sangkatauhan ng mga nabubuhay na patay, na ngayon ay umaatake sa maliliit na lungsod at pinapatay ang mga tao at ginawang mga katulad nito. Ngunit may mga matapang na tao sa mundo na nag-armas upang ipagtanggol ang kanilang mga pamayanan. Ikaw sa laro Pixel Shot ay magiging isa sa mga ito. Ang iyong karakter ay magkakaroon upang tumakbo sa pamamagitan ng mga kalye ng bayan at hanapin ang lahat ng mga zombies. Sa tulong ng kanyang makapangyarihang mga armas, siya pagpapaputok sa kanila ay magagawang upang sirain ang lahat ng mga monsters. Sa paraan, magkakaroon siya ng mangolekta ng iba't ibang mga item na makakatulong sa kanya sa paglaban sa mga patay na buhay.
