Sa ikatlong bahagi ng laro Alien Attack 3, muli mong i-pagtataboy ang atake ng mga dayuhan. Ang kanilang barko ay nakarating sa timog ng Amerika malapit sa isang maliit na bayan. Ang nakarating na hukbo ng mga sundalo nakuha ang lungsod at nagsimulang i-export ang mga naninirahan sa barko para sa mga eksperimento sa kanila. Ikaw bilang bahagi ng isang paglayo ng mga sundalo ay kailangang pumasok sa lungsod at sirain ang lahat ng mga dayuhan. Paglipat sa mga kalye ng lungsod, maingat na tumingin sa paligid. Kapag nakikita mo ang kaaway, mahuli ito sa paningin ng iyong makina at magbukas ng bagyo na apoy. Sikaping lumipat palagi upang gumawa ng pagbaril na mahirap para sa iyo. Kapag pagpatay ng isang kalaban, maaari kang mag-drop ng isang armas na maaari mong kunin at gamitin laban sa mga kaaway.
