Sinisikap ni Mario at Pacman na mangolekta ng mga mushroom na lumaki sa malawak na three-dimensional labirint ng Mario Pacman 3D. Ang bawat isa sa mga kasamang ito ay nagsisimula sa landas mula sa kanyang tagiliran ng labirint. Ang mga ito ay napapalibutan lamang ng mga pader ng ladrilyo ng iba't ibang kulay at mga bagay na kailangan upang maipon upang maipakita ang di-nakikitang mga pantao. Sundin ang sama-sama lamang pasulong at lumiko sa gilid sa kaganapan na nakikita mo ang isang pagpasa sa isang bagong lokasyon. Sa kalsada ay makikita mo ang mga multo. Maging labis na maingat na huwag tumakbo sa isang gang ng mga uhaw sa dugo na mga monsters. Patakbuhin ang nangunguna sa kabaligtaran direksyon upang mahanap ang kaligtasan mula sa kanila.