Kabilang sa mga ninjas, pati na rin sa mga ordinaryong tao, ang mga masamang tao at ang bayani mula sa laro Ninja Fighter ay sumama sa kanila at kailangang makipag-away. Hindi siya nag-iisa, may mga boluntaryong katulong at darating sila. Ngunit ang pangunahing pag-asa para sa mga bayani, na kung saan ay mong pamahalaan. Siya ay mas malakas, mas tuso, at lahat ay susunod sa kanya. Hanapin ang mga kaaway at sirain ang mga ito. Sila ay malakas at may parehong mga lihim bilang ang pinaka-advanced ninjas. Ngunit ang kanilang kahinaan ay ang mga ito ay masama at walang prinsipyo, at ang mabuti ay laging nakakamit ang kasamaan. Pamahalaan ang mga arrow na iginuhit sa ibaba ng screen kung nagpe-play ka sa isang touch screen device. Kung mayroong isang keyboard, gamitin ang mga key ng ASDW.
