Sa mga sinaunang beses sa serbisyo ng mga emperors ng Japan ay ang pagkakasunud-sunod ng mga ninja. Ang mga mahiwagang digmaan ay nagtataglay ng pinakamahusay na mga kasanayan sa katalinuhan sa panahong iyon at lahat sila ay mga martial artist. Ngayon, sa laro Ninja Run, tutulungan ka namin ng isang ganoong digmaan upang makalusot teritoryo ng kaaway. Ang aming mga bayani ay tatakbo kasama ang kalsada, na puno ng iba't ibang mga traps at iba pang mga panganib. Maaari mong karamihan sa kanila tumalon sa bilis at tumakbo sa. Kung matutugunan mo ang mga sundalo ng kaaway, sikaping sirain ang mga ito. Din sa kalsada mangolekta ng iba't ibang mga item na nakahiga sa lupa. Bibigyan ka nila ng mga puntos at iba pang magandang bonus.
