Tuwang-tuwa at mapamaraan kaibigan Phineas at Ferb ay sa museo at mawala. Tulungan ang mga ito makahanap ng isang paraan sa labas at kumuha sa labas ng kalituhan ng museo. Habang ang mga bayani ay tatakbo sa pamamagitan ng bulwagan, namamahala upang mangolekta ng mga item at gamitin ang mga ito sa kanilang destinasyon.